Se os aplicativos forem instalados silenciosamente (sem a caixa de diálogo de instalação usual), presumivelmente, esses aplicativos serão chamados diretamente pm, ou seja PackageManager, que como aplicativo do sistema tem a permissão android.permission.INSTALL_PACKAGES.
O telefone precisa estar enraizado para que o aplicativo possa chamar pmem um contexto raiz; caso contrário, você será recebido com a mensagem "Nem o usuário xxxx nem o processo atual tem android.permission.INSTALL_PACKAGES".
EDIT: Como o @Izzy apontou no comentário, android.permission.INSTALL_PACKAGEStambém é concedido aos aplicativos instalados no /system. Veja o comentário abaixo e esta pergunta para mais informações.