Na verdade, eu tinha meu sdcard no ext4 e o montei permanente no momento da inicialização (tenho root no meu telefone).
O maior problema foi que os aplicativos não esperam verificação de permissão no / sdcard, mas o extX impõe isso (nenhuma opção de montagem). Portanto, se um aplicativo armazena, por exemplo, algum áudio lá e chama outro subcomponente para reproduzi-lo, ele falha.
O mesmo vale para as fotos (as fotos são tiradas pela câmera, algum visualizador pode querer acessá-las).
Você pode corrigir isso manualmente, mas precisará executar após cada novo arquivo criado ... Haveria uma boa solução real para isso, mas requer modificação do sistema: deixe os aplicativos executarem com umask (002) em vez de 022. O Android é UPG (Grupos Privados de Usuários), para que não haja grandes danos. - Agora, os aplicativos podem escolher se desejam expor arquivos para outras pessoas, definindo o grupo como "sdcard" ou não. Isso também adicionaria a uma separação forçada onde os aplicativos o desejam.