Eles indicam que o aplicativo foi atualizado recentemente e ainda não foi iniciado desde a atualização.
O ponto azul claro aparecerá se o iOS 7 atualizou o aplicativo com Atualizações Automáticas ou se o usuário o atualizou manualmente.
No iOS 6, quando você instalava um novo aplicativo, seu ícone exibia um pequeno banner "novo" em um canto. No iOS 7, novos aplicativos são representados por um ponto azul. Esse ponto também aparece quando você atualiza um aplicativo existente (ou o SO atualiza para você em segundo plano). Nos dois casos, o ponto desaparece depois que você inicia o aplicativo pela primeira vez.
http://reviews.cnet.com/8301-19512_7-57603848-233/five-quick-ios-7-mysteries-solved/