O Adobe Reader 10.x se esforça para ocultar as opções normais de impressão do OS X, mas você ainda pode acessá-las clicando no botão Impressora ... na parte inferior da caixa de diálogo Adobe Print e clicando no aviso não para mudar as coisas pelas costas da Adobe.
Não tenho um formulário como você mencionou em vermelho, mas tente definir todas as opções de impressão na Adobe para fazer com que seu formulário apareça como desejado (com ou sem carimbos, anotações, notas e resumos, etc ...) e obtenha na caixa de diálogo de impressão Apple para tentar imprimir em PDF.
Se a Adobe não estiver preparando o arquivo para impressão até depois que você clicar em imprimir na caixa de diálogo da Adobe - seu único recurso será falsificar, definindo uma nova impressora virtual. Dessa forma, o Adobe é forçado a enviar os dados para o mac, que os inserem em um arquivo PDF mais simples para você, apenas com os dados preenchidos.
Não recorri a isso, mas o CUPS-PDF e esta dica sobre como fazê-lo funcionar com a segurança de sandbox do Snow Leopard parecem promissores. Espero que você não precise recorrer a essa solução hacky para economizar tempo e desperdício de papel.