No Safari no Mavericks, às vezes recebo uma caixa de diálogo dos sites indicando que algumas funções do site serão bloqueadas ou degradadas, a menos que eu desative o modo Navegação Privada. A maioria dos usuários provavelmente espera que a escolha de usar a Navegação Privada seja privada. Minha impressão é que outros navegadores principais não vazam o estado de Navegação Privada para sites.
Percebi que, enquanto no modo Navegação privada, o Safari não solicita favicons; portanto, em teoria, um site pode bloquear o cache do favicon e adivinhar bastante que a Navegação Privada está ativada.
Por outro lado, no iOS, o Safari não solicita favicons. Mas, mesmo no modo Navegação privada, solicitará qualquer "ícone de toque da maçã" se você acessar o painel Compartilhamento (o ícone de toque da maçã será usado como o ícone da tela inicial se, posteriormente, "Adicionar à tela inicial" URL).
Além do favicon, existem outras maneiras conhecidas de um site determinar (ou adivinhar com precisão razoável) que você está usando o modo de Navegação Privada no Safari da área de trabalho?