O que você está enfrentando é um efeito colateral do encerramento automático, um recurso que foi introduzido no 10.7 Lion. Esse recurso permite que o sistema operacional desligue os aplicativos sempre que precisar dos recursos que estão usando ou quando decidir que não os está mais usando. No entanto, embora remova o aplicativo da tela, se ele tiver recursos suficientes, ele manterá o processo em estado de suspensão, caso você planeje reutilizá-lo, permitindo que ele seja reiniciado rapidamente.
Você pode testar isso facilmente, abrindo um único JPEG na visualização. Se você fechar o JPEG e trazer outro aplicativo para o primeiro plano, verá a Visualização desaparecer da sua estação quase instantaneamente. No entanto, se você verificar o Activity Monitor, por um tempo, ainda deverá ver a Visualização listada, mas com uma CPU 0,0, e se executar, ps -j | grep Preview
deverá ver o processo listado, mas com o estado definido como "S" para dormir.
Se a Visualização estava impedindo você de limpar arquivos PDF do seu Mac, meu palpite é que você tinha os arquivos abertos na Visualização, mas o aplicativo estava em segundo plano por um tempo, então o sistema operacional decidiu que não estava mais usando e fechou. . No entanto, ele ainda tinha o processo de visualização em execução no estado de suspensão pronto para voltar rapidamente à vida, se você desejar, mantendo coincidentemente o acesso aos arquivos PDF abertos, impedindo que eles sejam excluídos. Com o tempo, o sistema operacional liberaria o Preview da memória e também reteria os arquivos.