Respostas:
Tente limpar o cache do Safari (Safari-> Empty Cache).
A próxima coisa a garantir é que você não possui extensões ou folhas de estilo personalizadas.
Além disso, dependendo do seu CSS, o tamanho da tela e da janela pode afetar o posicionamento. Verifique se você está usando viewports de tamanho idêntico.
Caso contrário, se os dois navegadores (e SOs) forem realmente da mesma versão e você estiver direcionado para o mesmo site, eles deverão ser idênticos.
Você já tentou usar um navegador diferente?
Além disso, observe que qualquer dúvida sobre código (como corrigir isso contaria) precisa ser postada no StackOverflow em vez de aqui.