Respostas:
A resposta a sua pergunta é não.
Aqui está uma tela do Mail.app do meu Yosemite
Você tentou reiniciar?
Parece ser um bug e foi relatado à Apple.
Uma discussão nos fóruns da Apple menciona esse mesmo problema, o e- mail do Yosemite do OS X parou de mostrar a contagem total de mensagens na caixa de entrada :
Isso parece ser um bug. Ele é acionado quando você visualiza uma pasta inteligente - assim que você fizer isso, a contagem na barra de título desaparecerá até que você reinicie o e-mail.
Eu arquivei isso como um bug com a Apple, então eles estão cientes disso. Nenhum ETA para uma correção embora.