Eu instalei o iTerm2, joguei um pouco com as preferências.
Agora voltaria à configuração inicial, mas remover o aplicativo e localizar e remover qualquer arquivo no disco aparentemente relacionado ao aplicativo não ajuda: após a reinstalação, as preferências ainda são as modificadas.
Como você removeu os arquivos relacionados? Além do diretório Library / Preferences /, também pode haver algo salvo em Library / Preferences / ByHost /
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Kent