Depois de ativar o FileVault no El Capitan, a partição é criptografada em uma primeira passagem. Após a conclusão dessa fase, inicia-se uma segunda fase de otimização, que leva consideravelmente mais tempo que a primeira fase de criptografia. A etapa de otimização não estava presente na primeira aparição do FileVault 2 (OS X Lion). A fase de criptografia levou a mesma quantidade de tempo na época. Então, o que é isso otimizando?
Meu sistema é um MBP de meados de 2014 com 1 TB SSD. A 1ª fase foi realizada em cerca de 12 horas. A segunda fase de otimização é agora às 20 horas e contando.
