Respostas:
É um microfone, útil para gravação de vídeo usando a câmera traseira e para eliminar digitalmente o ruído de fundo quando você está em um telefone ou em uma chamada do FaceTime. Fonte - suporte da Apple .
A Apple não tem uma opinião explícita sobre se o microfone traseiro não pode ser coberto, mas nesse artigo de suporte,
Remova protetores de tela, filmes ou caixas que cobrem o microfone, o microfone iSight ou o receptor do iPhone.
é o terceiro passo recomendado para pessoas com problemas de microfone.
Isso é um microfone. Eu não me preocuparia com um case cobrindo demais, já que o seu iPhone 5s tem vários microfones nele. Obviamente, seria melhor se o caso não cobrisse, no entanto.