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Respostas:
O que poderia ter causado isso?
O macOS Sierra 10.12.5 beta (e o 10.12.4 beta antes) incluíam uma ferramenta eficheck. Esta ferramenta foi projetada para verificar seu firmware EFI lendo dados do flash da Interface Periférica Serial (SPI) e verificando se sua assinatura é válida (ou seja, não foi adulterada). Basicamente, está fazendo isso para evitar problemas de estabilidade e segurança do sistema.
Portanto, se você tivesse instalado um desses betas, isso explicaria o que causou isso. Se você não instalou nenhum desses betas, não tenho certeza - exceto para dizer que é muito provável que a ferramenta eficheck seja incluída na versão pública do macOS Sierra 10.12.5. Não acredito que tenha feito parte do lançamento público do mac OS Sierra 10.12.4.
De qualquer forma, você pode kextstatprocurá- lo digitando o comando no Terminal e pesquisando a saída através do CommandFatalho Find e pesquisando eficheck.kext (ou parte dele).
Eu vejo o arquivo eficheck.bin, como posso saber se meu firmware EFI está bom?
Mais uma vez, estou trabalhando no pressuposto de que você instalou o beta. Nesse caso, eu não me preocuparia com isso, pois muitos usuários relataram ter visto isso, mesmo que o firmware não tenha sido modificado etc.
Depois de enviar isso para a Apple, o que acontece a seguir?
Se você optar por enviar os dados relevantes para a Apple, apenas as alterações inesperadas no firmware do computador e apenas os detalhes gerais do computador (como modelo) serão coletados e transmitidos. Em termos do que acontece a seguir, bem, não sei exatamente o que a Apple fará com esses dados. Só o tempo irá dizer.
Mais informações estavam disponíveis em: https://support.apple.com/kb/HT207475, mas já foram removidas (estavam lá há três dias). Eu o incluo aqui porque espero que a Apple a republique após o lançamento do macOS Sierra 10.12.5. Caso contrário, editei / excluí-lo (conforme apropriado) desta resposta.