Respostas:
Sim, você pode remover os aplicativos da pasta Aplicativos Móveis na sua biblioteca do iTunes e Transferir Compras não fará mais o download dos aplicativos. No entanto, se o aplicativo for removido da sua lista de compras da App Store, o IPA será a única maneira de reinstalar o aplicativo no futuro.
Isso pode causar algum arrependimento, já que o IPA que o iTunes costumava baixar era versões especiais dos aplicativos que contêm todo o aplicativo. Atualmente, a maioria dos aplicativos na loja foi reduzida e, quando você baixa um aplicativo no iPhone, é uma versão fina, pulando partes necessárias apenas no iPad, por exemplo.
Se você não mantiver uma cópia de backup do IPA completo e uma cópia do iTunes anterior a 12.7, perderá a capacidade de reinstalar a partir da imagem completa.
Isso não é muito problemático se o aplicativo escolhido neve mudar ou nunca for removido da App Store online. Isso também não é muito problemático se você atualiza seu hardware com frequência. Para pessoas interessadas em executar hardware mais antigo e sem suporte e / ou aplicativos abandonados ou versões antigas de aplicativos, isso pode ser um problema substancial.