Respostas:
/Library/Bundles
Reiniciar. Se você não tiver mais problemas, poderá excluir este pacote. Obrigado eclecticlight por esta dica.
Existem duas maneiras de fazer isso. O primeiro deve impedir o prompt de atualização para o sistema operacional mais recente, enquanto o segundo impedirá a App Store de incomodá-lo por atualizar qualquer coisa.
O mais recomendado é acessar a App Store, selecionar a guia Atualizações, clicar com o botão direito do mouse na atualização que você deseja deixar de ser incomodada e selecionar "Ocultar atualização".
A alternativa é acessar as Preferências do sistema, clicar na App Store e desmarcar "Verificar atualizações automaticamente". Isso deve impedir a App Store de incomodá-lo com todas as atualizações disponíveis.