Acidentalmente instalado um sistema, como removê-lo completamente?

Eu cometi um erro neste fim de semana e agora não tenho certeza de como corrigi-lo. Eu estava clonando meu disco rígido de inicialização (Sierra) em um arquivo de imagem em um disco rígido externo, usando o Carbon Copy Cloner. Não é grande coisa, feito milhares de vezes antes. Mas neste momento em particular, eu farted e negligenciado para dizer ao CCC para clonar um arquivo de imagem, em vez de selecionar o disco rígido externo em si. Isso significa que o CCC clonou todo o meu sistema de inicialização, na unidade externa, onde não deveria haver nenhum sistema inicializável.

Eu gostaria de "desfazer" isso e, de alguma maneira, remover o sistema operacional inteiro e todos os seus arquivos associados, da unidade externa, sem afetar o restante do conteúdo da unidade (portanto, limpar a unidade, por exemplo, não é uma opção).

Existe alguma maneira eficiente de fazer isso? É apenas uma questão de destruir manualmente todas as pastas do sistema (e as pastas invisíveis associadas, como / usr, / sbin, etc.) e esvaziar a lixeira?

Edit: Aqui é o meu diskutil list saída:

/dev/disk0 (internal, physical):
   #:                       TYPE NAME                    SIZE       IDENTIFIER
   0:      GUID_partition_scheme                        *500.1 GB   disk0
   1:                        EFI EFI                     209.7 MB   disk0s1
   2:                  Apple_HFS Media Server            499.8 GB   disk0s2

/dev/disk1 (external, physical):
   #:                       TYPE NAME                    SIZE       IDENTIFIER
   0:      GUID_partition_scheme                        *8.0 TB     disk1
   1:                        EFI EFI                     209.7 MB   disk1s1
   2:                  Apple_HFS Media1                  8.0 TB     disk1s2

/dev/disk2 (external, physical):
   #:                       TYPE NAME                    SIZE       IDENTIFIER
   0:      GUID_partition_scheme                        *8.0 TB     disk2
   1:                        EFI EFI                     209.7 MB   disk2s1
   2:                  Apple_HFS TM iMac                 8.0 TB     disk2s2

"Media1" é o drive externo em questão aqui, que agora possui todos os arquivos que ele já possui, além de uma cópia do sistema operacional do "Media Server".

Editar 2:

total 45
drwxrwxr-x+ 51 root  admin  1734 Dec 22 21:03 Applications
drwxr-xr-x+ 61 root  wheel  2074 May 17  2018 Library
drwxr-xr-x@  2 root  wheel    68 Feb 20  2017 Network
drwxr-xr-x@  4 root  wheel   136 Dec 23 11:25 System
drwxr-xr-x   6 root  admin   204 Feb 11  2018 Users
drwxr-xr-x@  5 root  wheel   170 Jan  1 14:18 Volumes
drwxr-xr-x@ 38 root  wheel  1292 Dec 23 11:25 bin
dr-xr-xr-x   3 root  wheel  4324 Jan  1 13:40 dev
lrwxr-xr-x@  1 root  wheel    11 Feb 11  2018 etc -> private/etc
dr-xr-xr-x   2 root  wheel     1 Jan  1 13:47 home
-rw-r--r--@  1 root  wheel   313 Dec 21  2016 installer.failurerequests
dr-xr-xr-x   2 root  wheel     1 Jan  1 13:47 net
drwxr-xr-x@  6 root  wheel   204 Feb 11  2018 private
drwxr-xr-x@ 63 root  wheel  2142 Dec 23 11:25 sbin
lrwxr-xr-x@  1 root  wheel    11 Feb 11  2018 tmp -> private/tmp
drwxr-xr-x@ 10 root  wheel   340 May 17  2018 usr
lrwxr-xr-x@  1 root  wheel    11 Feb 11  2018 var -> private/var

sierra carbon-copy-cloner

— Jonathan van Clute
fonte

Eu apenas clonaria "de volta" para o seu Mac, mas desta vez faça um arquivo como você pretendia. Em seguida, limpe a unidade e escreva o arquivo de imagem de volta para ele.

— Allan

Você me perdeu lá. A questão é que a unidade externa tem um zilhão de arquivos, e agora também tem uma pasta do sistema instalada que eu não quero lá. Limpar a unidade externa simplesmente não é uma opção porque eu teria que fazer uma restauração massiva de vários terabytes a partir do backup e realmente não quero fazer isso.

— Jonathan van Clute

Se você clonou sua unidade de inicialização em seu disco externo, sobrescreveu os arquivos que estavam lá. Apenas para confirmar, você consegue acessar esses arquivos (aqueles antes da sobreposição)?

— Allan

Não é isso, não substituiu nada. Apenas adicionou um clone da minha unidade de inicialização ao disco externo. Que francamente eu fiquei um pouco surpreso (e muito aliviado também!). Sim, eu posso acessar tudo, o drive externo está perfeitamente intacto, só tem esse sistema extra agora.

— Jonathan van Clute

Adicionando-o à questão agora ...

— Jonathan van Clute