Se o arquivo ou diretório tiver atributos estendidos, você verá um @ no campo de permissões. Para informações de segurança estendidas (ACLs), você verá um +.
A partir man ls
do OS X:
-@ Display extended attribute keys and sizes in long (-l) output.
O xattr
programa pode ser usado para exibir e manipular atributos estendidos. Veja o que está lá antes de decidir excluir esses atributos. Definitivamente, dê uma olhada rápida na página de manual do xattr também.
Um exemplo rápido de um exemplo de código de compromisso PHP que eu mantenho aqui para referência:
$ ls -@l php-compromise.php
-rw-r--r--@ 1 user group 502620 Jul 5 2011 php-compromise.php
com.apple.FinderInfo 32
com.apple.TextEncoding 15