IIRC, o FileVault2 gera suas próprias chaves de criptografia quando você começa a usá-lo. Ele usa essas chaves para criptografar a unidade, não sua senha. Isso é diferente do FileValut1, que usa sua própria senha.
As chaves em si, quando armazenadas no disco, são ENTÃO criptografadas usando sua senha e, portanto, só podem ser usadas para ler o disco se você tiver a senha. É por isso que várias contas podem desbloquear o disco no FV2 e como a "chave mestra" pode existir (várias cópias criptografadas das chaves de armazenamento do FV2).
Sim, alterar sua senha significa que essa nova senha é necessária para acessar as chaves de armazenamento e, portanto, a unidade. Mas isso apenas desencadeia uma re-criptografia das chaves, que são muito pequenas, e não a unidade inteira.
Como FV1 e FV2 são dois esquemas de criptografia totalmente diferentes, o fato de você migrar da 10.6 não deve importar. Não tenho certeza se o Lion é compatível com os diretórios FV1, mas enquanto você estiver usando o FileValut2, a alteração da senha deverá funcionar como descrito acima.