Existem diferentes maneiras de modelar algo. Pelo que você está perguntando, existem dois tipos principais de modelagem: modelagem direta e modelagem inversa.
Modelagem Avançada
Nesse tipo de modelagem, você tem um modelo específico que define o estado "atual" do seu sistema. No caso de atmosferas de exoplanetas, provavelmente seria algo que define o conteúdo molecular, o nível de ionização, a densidade etc. da atmosfera de seu exoplaneta. Em seguida, você usa a física / matemática conhecida do seu sistema para decidir como ele se comportará. Nesta configuração, o que você criou é um sistema para prever estados do sistema a partir de um modelo de física predeterminado.
Esse exemplo seria alguém criando sua própria atmosfera de exoplaneta em um modelo e depois dizendo: tudo bem, o que acontece quando eu brilho a luz através dessa atmosfera. Que observações posso registrar?
Modelagem Inversa
Em certo sentido, isso é o oposto da modelagem direta, embora não signifique realmente que você esteja executando um modelo para ver o passado. Em vez disso, o que acontece com essa configuração é que você conhece um estado ou resultado específico e deseja construir um modelo do seu sistema que possa produzir esse estado. Essencialmente, você deseja que seu modelo chegue a um determinado estado quando terminar o cálculo. Nesse caso, você tem uma confiança razoável de que seu modelo era uma indicação de como é realmente o seu sistema.
Nesta situação, você mede componentes da atmosfera, por exemplo, o raio do planeta em função do comprimento de onda e depois cria um modelo da atmosfera que, esperançosamente, pode reproduzir suas observações. Se você puder, a esperança é que o modelo represente com precisão o que é seu sistema.