Existem algumas maneiras de fazer a detecção do ímã:
Interruptor Reed (um interruptor que fecha fisicamente com um campo magnético). Se você trocar os dois fios, o sensor funcionará bem (isto é, não importa). Você pode testar isso usando o modo testador de continuidade do seu multímetro (você terá continuidade se o ímã estiver próximo ao sensor e abrirá o circuito com o ímã distante).
Sensor de efeito Hall (geralmente, existem 3 fios aqui: Vdd, terra e a saída do sensor). Existem 3! = 6 maneiras de conectá-lo (portanto, 5 maneiras de estragar tudo). Provavelmente, você não receberá uma leitura do sensor até acertar se não o conectar corretamente. Como observado por Chris H, se você tiver um sensor de efeito Hall, é provável que os fios sejam codificados por cores, para que você descubra Vdd e terra, e o restante é emitido. Seu multímetro realmente não vai ajudá-lo aqui.
Um indutor (basicamente, uma bobina de arame). Se você trocar os dois fios, o sensor funcionará bem (seria equivalente a mover o sensor para o outro lado da bicicleta, ou seja, não importa). Seu multímetro sempre mostrará continuidade, mas se você tiver um medidor de LCR, poderá verificar a indutância. Se você medir a resistência, verá alguns ohms.
Então, basicamente, se você tem 2 fios, é possível trocá-los sem se preocupar e a coisa deve funcionar. Se você tiver 3, talvez seja necessário desmontar o sensor, descobrir qual sensor está lá e procurar a pinagem (ou adivinhar com base no código de cores dos fios).
Existem mais alguns tipos de interruptores magnéticos, mas é improvável que ocorram neste aplicativo.