A indicação da pergunta implica uma agenda, mas responderei de qualquer maneira.
Por um lado, fiquei desapontado ao ver nenhuma menção a Vera Menchik aqui. Primeira campeã mundial feminina, ela derrotou muitos dos melhores homens do seu tempo, incluindo o campeão mundial Max Euwe (duas vezes!), Além de Sammy Reshevsky, Jacques Mieses e Lajos Steiner. Hastings 1930-1, Euwe perdeu apenas um jogo em todo o evento - para Menchik.
Agora, o OP afirma, sem nenhum apoio visível, que a disparidade de não pode ser explicada pela população, mas isso é algo que minha própria experiência de mais de uma década organizando uma boa parte dos eventos mais fortes do meu estado me leva a acreditar que é absolutamente verdadeiro. A porcentagem de mulheres que jogam xadrez nos eventos que organizei ficou bem abaixo de 1% do total de jogadores (em quase metade desses eventos, era 0). E se, durante o mesmo período de tempo, decidirmos usar um total de jogadores únicos (cada indivíduo conta como 1 jogador, não importando quantos eventos meus eles disputaram), esse número não seria maior. Portanto, a disparidade no número de jogadores explicaria facilmente a diferença de população entre os 100 melhores. Na verdade, estou impressionado com 2%.
Seguindo em frente, ainda não vi nada provar a noção popular de que os jogadores de xadrez são mais inteligentes que a população em geral. Todos nós podemos pensar em jogadores de xadrez de alto nível que defenderam algumas idéias bastante enlouquecidas. Conheço várias pessoas muito inteligentes que nunca passaram dos níveis iniciantes no xadrez e outras que o fizeram. Correlação fraca, na melhor das hipóteses, parece-me.
Penso que devemos rejeitar a alegação de "gênio" na pergunta original da mesma maneira. Nenhuma prova disso.
Um dos campos mais interessantes para este estudo está nos jogadores muito jovens. Nas listas da USCF, a concentração de mulheres entre as 20 primeiras ou as 100 melhores é maior nas idades anteriores, com números de 10% ou mais sendo mulheres nas listas jovens, caindo para 2% ou mais nas listas mais antigas. . Isso é paralelo à minha experiência como treinador de xadrez; havia mais alunas em minhas turmas mais jovens do que as mais antigas.
Falei com alguns dos mais promissores sobre o motivo de terem parado. Os motivos para se afastar do xadrez eram variados. Alguns fizeram isso por causa do que chamaríamos de "socialização" - eles sentiram pressão do mundo exterior (colegas, familiares, outras figuras de autoridade) para parar de jogar xadrez porque simplesmente não era "algo que as meninas deveriam fazer". Alguns fizeram isso pela mesma razão que os homens se afastaram mais tarde na vida - ficaram muito ocupados ou ficaram mais interessados em outras coisas (de atividades sociais a assuntos de STEM, como Química ou Matemática).
Mas para alguns, o motivo foram os meninos. Não está mais interessado nos meninos do que no xadrez, mas menos interessado no xadrez por causa da atitude dos meninos jogando. Conheço várias garotas que continuaram a ler sobre xadrez, mas nunca apareceram ou sentaram-se para jogar em um clube por causa da tendência dos meninos de idade semelhante (pré-adolescente a adolescente) de denegri-los. (A denegação, posso atestar pela observação, veio independentemente da habilidade, de fato, quanto melhor o garoto estava no xadrez, menos ele tendia a zombar das meninas que jogavam bem. Parecia mais uma tática empregada fora do jogo para impedir que meninos medíocres percam para um jogador melhor. Visto como tal, eu teria que dizer que funcionou; se ela não jogasse, era uma ameaça a menos para ele enfrentar.)