Livros introdutórios sobre ciências da natureza por trás da bioinformática


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Minha pergunta é para aqueles que se preocupam com algoritmos de biologia computacional. Vou fazer um curso de bioinformática neste outono; o problema, no entanto, é que eu tenho muito pouco conhecimento em biologia e química para me sentir preparado para esse ciclo de leituras (eu era bastante fraco nessas matérias na escola).

Você poderia recomendar algum livro que proporcionasse uma boa introdução às questões das ciências naturais nas quais a bioinformática se concentra?


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Em outras palavras, você está procurando livros de biologia? Nesse caso, a questão deve ser sobre biologia . Votação para fechar como offtopic.
Raphael

Pela minha experiência em bioinformática, você não precisará de muita biologia - se os cursos forem ministrados por cientistas da computação. Você deve perguntar ao professor que dará as palestras quanto conhecimento prévio é assumido.
Raphael

É uma pergunta totalmente válida para CS.
Gigili

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Este foi o nosso livro de referência no curso de bioinformática, é isso que você está procurando? Você poderia nos contar mais sobre o conteúdo do curso?
Gigili 9/04/12

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@Gigili - realmente ?! À primeira vista, um livro sobre redes neurais parece ter pouco a ver com a bioinformática cotidiana. A Biologia Computacional / Bioinformática normalmente não pega idéias biológicas e as aplica em ciências da computação; é mais comum a aplicação da ciência da computação na solução de problemas biológicos.
iandotkelly

Respostas:


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Como uma resposta anterior afirmou, não é um requisito absoluto que você estude biologia para fazer bioinformática. No entanto, se você deseja ter uma compreensão básica dos conceitos fundamentais, como genes, RNA, DNA, etc., um bom livro introdutório de biologia deve fornecer tudo o que você precisa.

A biologia molecular não é o tipo de tópico em que se possa simplesmente mergulhar no meio. Portanto, para entendê-lo, você precisa fazer algumas leituras introdutórias. O melhor livro é aquele que tem detalhes suficientes sem supor que você deseja se tornar um biólogo.

Eu sugiro que você olhe para o Collins Outline of College Biology. A leitura dos capítulos 2-5 e 12-15 deve fornecer as informações básicas que você deseja. Outra opção é Outline of Biology, Schaum, Third Edition, capítulos 2-4 e 7-10. Ambos os livros custam menos de US $ 20,00 e são fáceis de entender. Espero que isto ajude.


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Como alguém que veio de uma formação em ciência da computação e liderou uma equipe desenvolvendo um produto envolvendo bioinformática, posso simpatizar com o desafio de escolher o domínio - mas é uma área fascinante para se trabalhar.

Como o @JCEHR apontou, não é um requisito absoluto estudar biologia, mas é útil começar a buscar alguns dos diretores. Bioinformática não é apenas biologia molecular, sequenciamento genômico, expressão de proteínas e estrutura de proteínas (não se preocupe se você não entender esses termos agora), mas estou bastante confiante de que esta é a área em que a grande maioria da 'bioinformática tradicional' é aplicado e seria o núcleo de qualquer curso sobre o assunto. Uma das características mensuráveis ​​mais importantes do DNA, RNA e proteína é que elas são uma cadeia de moléculas que podem ser representadas por uma cadeia de software - a anotação, o armazenamento e a pesquisa (nebulosa) dessas cadeias são as principais técnicas.

Além de uma cartilha geral de biologia, você também pode considerar ler um livro que discute genômica. O seguinte parece bom, mas é meio caro:

Primer of Genome Science , de Greg Gibson e Spencer V. Muse


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Como um cientista da computação que fez o menor em Bioquímica, minha recomendação seria o guia de desenho animado de Larry Gonick para a genética .

Isto não é uma piada. Conheço vários bioinformáticos respeitáveis ​​que aprenderam genética dessa maneira. O livro explica a maior parte do que, se não tudo, você precisará conhecer e fornecer os recursos visuais mais intuitivos para envolver sua mente nos conceitos subjacentes. E é uma leitura divertida.


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Como outros lhe disseram: depende um pouco do livro que você usará, bem como dos tópicos ensinados. Às vezes, será bastante auto-explicativo. No entanto, para estar melhor preparado (e se acostumar com a terminologia), veja alguns primers na Web, como Preparata: um iniciador de biologia para cientistas da computação .

Temos colegas ou o site "biostar" é um clone amigável? Veja a pergunta: " Melhores recursos para aprender biologia molecular para um cientista da computação ".

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