Algoritmo para construir uma matriz de sufixos no tempo


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Ultimamente, tenho trabalhado com matrizes de sufixos e não consigo encontrar um algoritmo eficiente para criar uma matriz de sufixos fácil de entender. Eu já vi em muitos sites que existe umaO(nlog2n)algoritmo, mas não consigo entender, pois muitos detalhes importantes são omitidos. Há um exemplo no Top Coder .

Alguém poderia me apresentar um algoritmo eficiente para construção de matriz de sufixos, que é fácil de entender?

Respostas:


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Você pode calcular a matriz de sufixos em tempo linear com o algoritmo DC-3 . Este é um algoritmo sofisticado super legal que pode ser implementado em 50 linhas de código C ++ legível - um dos meus favoritos de todos os tempos. O código fonte está contido no documento original. Se você puder comparar dois caracteres em tempo constante e o tamanho do alfabeto fornO(1), o algoritmo DC3 é executado em O(n) Tempo.

Observe que você também pode obter a árvore do sufixo em tempo linear quando tiver acesso ao array de sufixos e ao array LCP. A matriz LCP também pode ser construída com o algoritmo DC3.


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Aqui está uma boa explicação para o O(nlog2n)algoritmo: http://www.stanford.edu/class/cs97si/suffix-array.pdf . Na verdade, usando a classificação de tempo linear, a mesma abordagem forneceO(nlogn) complexidade do tempo.

Se você tiver alguma pergunta específica sobre isso, não hesite em perguntar.

Eu concordo com A. Schultz que o DC-3 é super legal. Também não é muito complicado, mas oO(nlog2n) ainda é mais simples.

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