Aqui estão as diretrizes da EPA para limpeza de dutos e quando necessário. http://www.epa.gov/iaq/pubs/airduct.html
Lembre-se de que os dutos de fluxo de ar geralmente não são tão ruins quanto os comerciais que você imagina, a menos que o sistema funcione sem um filtro de ar. O filtro geralmente fica no retorno do ar, o que garante que todo o ar que flui para os dutos de suprimento esteja "limpo".
Portanto, se você vê muita porcaria em seus dutos de suprimento, provavelmente tem ar não filtrado entrando no sistema (furo em um duto, talvez). A outra maneira pela qual as coisas entram nos dutos de suprimento é de pessoas que jogam lixo nos registros de chão. Se houver sujeira nos registros, você pode retirá-lo levantando o registro e enfiando a mangueira do aspirador de pó. Apenas tome cuidado para não arrancar ou bater nas laterais dos dutos, o que pode danificá-los (eles podem derramar fibra de vidro).
Você pode ter coisas nos dutos de retorno (pêlos de animais, etc.), mas por causa do filtro de ar, isso geralmente não afeta muito a qualidade geral do ar na casa. A exceção seria se você tivesse algo nos dutos que o filtro de ar não prenderia (esporos de mofo, coisas fedorentas).