Parabéns pela cortiça. Coloquei cortiça no meu banheiro principal há alguns anos e foi o melhor piso que já tive - quente pela manhã e macio sob os pés descalços. Eu gostei tanto que coloquei cortiça na nossa cozinha também.
Meu sentimento é que você não precisa selá-lo. Eu não vi nenhum aumento ou inchaço em nosso andar por três anos. Também não somos pessoas meticulosas - basicamente apenas limpamos as poças com uma toalha quando as vimos.
Qualquer selante que você for capaz de selar as juntas será um acabamento de filme. Meu intestino diz que a sutil expansão e contração da cortiça junto com a flexão do piso quebrará um acabamento de filme como esse em pouco tempo, derrotando o objetivo.
Uma coisa que você pode tentar se estiver nervoso é uma cera transparente. Teste-o em um armário ou algo assim para ver se você pode forçar um pouco a costura e ainda removê-lo completamente da superfície. Além disso, verifique se o solvente da cera não danifica o acabamento das telhas de cortiça. Se funcionar bem, pode diminuir a penetração da água nas costuras, mantendo a flexibilidade.