Está correto. A impedância de 50 ohm refere-se à "impedância característica" da "linha de transmissão". Isso vem da teoria eletromagnética e é geralmente aplicável a aplicações de RF e alta frequência. Na CC, seu traço ainda será de impedância muito baixa (resistência). Se você usasse um ohmímetro, provavelmente mediria talvez 1 ohm ou 0,5 ohm, e isso ocorre apenas porque as resistências da sonda dominariam a resistência real do traço (que deve estar na faixa de dezenas de miliohms).
A impedância característica tem (principalmente) a ver com a capacitância e indutância por unidade de comprimento da linha de transmissão. A capacitância e a indutância não são tão importantes em frequências baixas, mas à medida que a frequência do sinal aumenta, elas causam efeitos que não podem mais ser ignorados. É por isso que você costuma ver cabos coaxiais anunciados como 50 ohm ou 75 ohm. Isso se refere à impedância característica (aplicável a frequências mais altas, como faixa superior de MHz e GHz), não à resistência DC.
Como a impedância característica depende de C e L por unidade de comprimento, desde que você não altere a distância entre o traçado e o plano de aterramento (afeta a capacitância) nem a largura do traço (afeta a indutância), sua impedância característica não deve ser alterada, não não importa quanto tempo o rastreamento seja (Nota: esta é uma explicação simplificada, mas captura a ideia básica).
Observe que muitas vezes a palavra "característica" é retirada do termo e é chamada apenas de "impedância". Parece que esse é o caso do seu programa de layout.