O som é resultado do sistema criar grandes campos magnéticos em função de como ele opera. Esses campos estão flutuando, provavelmente a 50Hz, com base na sua tensão de entrada, mas talvez 60Hz, se você estiver nos EUA.
Esses campos magnéticos pressionam e puxam os componentes do sistema, pois não é possível um amortecimento perfeito. Esses componentes vibram. Algumas das coisas que você ouve não estão em 50 / 60Hz, mas também são harmônicas dessa frequência e interações com outros componentes.
Você definitivamente não deve fazer nada que limite o fluxo de ar ou crie uma situação em que o transformador possa superaquecer.
Você pode bisbilhotar um pouco (com cuidado) e ver se consegue encontrar componentes ou painéis específicos que estejam vibrando e tentar usar algo para atenuar a vibração. O material de amortecimento a alta temperatura pode ser uma opção.
Dito isto, os transformadores desse poder são basicamente impossíveis de silenciar. O núcleo do transformador ou os enrolamentos provavelmente estão vibrando e causando a maior parte do ruído. Em níveis de potência suficientemente altos, o próprio núcleo de ferro na verdade se estende e se contrai, causando vibração.
Alguns projetos tentam isolar o núcleo para impedir que as vibrações sejam transferidas para outros componentes, mas não é algo que você possa consertar após o mercado.