Ei cara, você ainda pode usar o avrstudio no ubuntu. Pensando como você pode fazer isso ...
A resposta é apenas instalar o aplicativo wine e executar os softwares windows com wine.
Avr studio, proteus ... até jogos do windows podem ser executados no ubuntu com vinho.
Você não precisa nem mexer com os makefiles blá blá. (Basta instalar com o vinho e começar).
Existem muitos sites para começar a usar os avr MCUs, como extremos eletrônicos, tutoriais sobre AVR etc. Basta fazer uma pesquisa no google.
Vou explicar em detalhes como instalar o avrstudio 4 no wine, já que o avrstudio 5 e 6 não funciona com ele, mas você pode usar a caixa virtual no linux para executar até o avr stud 5 e 6 com janelas na caixa virtual.
Abra o centro de software Ubuntu, digite wine na pesquisa e instale-o.
Em seguida, obtenha a configuração para avrstudio4 e você também precisa instalar o win avr
tente estes links para
uma. avr studio 4 http://mycomsats.com/blogs/download-atmel-avr-studio-4-free/
b. win avr http://sourceforge.net/projects/winavr/files/WinAVR/20100110/WinAVR-20100110-install.exe/download?use_mirror=kaz&r=http%3A%2F%2Fsourceforge.net%2Fprojects%2Fwinavr%2Ffiles% 2F & use_mirror = kaz
3.Abra a pasta onde está a configuração do AS (avr studio 4) e clique com o botão direito do mouse e abra-a com "windows wine program loader" ou "a wine application".
4.Então você precisa clicar nos próximos botões, como faria no Windows.
5.Em seguida, instale o win avr da mesma forma com o wine (entre na configuração do win avr ....).
6. Baixe o indicador de menu clássico do ubuntu software center. Você saberá disso em apenas cinco minutos.
7.No menu clássico -> vinho -> Programas -> avr tools
o sexto passo é um passo extra, para que você não precise mexer com o local onde a opção executável avrstudio4 está na pasta wine.