Não há nada de errado com a via no bloco por assim dizer. Como outras pessoas observaram, uma via aberta na almofada pode levar a problemas de solda, pois a solda é sugada pelo orifício da via. Com a soldagem manual, você ficará bem, é claro, também para pequenas tiragens, o fabricante pode preencher previamente o buraco com solda à mão com um ferro ou uma caneta de ar quente. Isso geralmente elimina a maioria dos problemas mencionados acima.
Fazer isso com um BGA pode ser engraçado ou triste, dependendo do seu conselho ou de alguém. As vias gostam de absorver toda a solda das bolas até a parte de trás do tabuleiro ou, no mínimo, fazer com que apenas uma bola crítica tenha um contato ruim ou fraco. Isso é legal quando isso falha em campo 3 meses depois :)
Para produção real novamente, nada de errado com o via in pad, é realmente útil em muitos casos. Tudo que você precisa fazer é fazer com que sua loja de PCB preencha os buracos. Normalmente, eu os deixo encher com material não condutor e, em seguida, aplainá-los de forma plana, para terminar com uma almofada plana de metal sólido para soldar. Há um pouco de somador de custos para isso, mas realmente não é tão ruim assim.
Apenas mais uma troca que você precisa fazer para ver se pode arcar com o custo extra.