É principalmente devido ao custo. Esses cristais em particular são muito baratos devido à indústria de relógios. Esta resposta fornece mais detalhes, eis um trecho:
Há 1,2 bilhão de relógios vendidos a cada ano. A maioria deles são relógios digitais baratos, exigindo um pequeno cristal de 32kHz. ...
Como resultado, esses cristais são extraordinariamente baratos ... [Outros cristais] custam de 10 a 100 vezes mais em quantidade do que esses cristais de relógio baratos.
Além disso, esses cristais são particularmente bem otimizados para baixa potência. Espera-se que os relógios em tempo real executem esse oscilador por 10 anos em uma célula do tipo CR2032. Para obter baixa frequência, baixa potência, pequenos cristais em outras frequências, você está observando um aumento substancial no custo.
Em volumes baixos, esses cristais ainda são menos dispendiosos do que a energia normal ou alta dos cristais de 25kHz ou 56kHz, mas custam a diferença não é grande até que você comece a fabricar volumes altos.
Escolha o que você precisa, mas se você estiver produzindo um produto de alto volume e puder ajustar seu design para funcionar com um cristal de 32kHz, haverá um incentivo financeiro substancial para isso.