O blob que você mostra é da construção COB (chip on board). O chip não está em um pacote separado. Ele é instalado diretamente na placa e, em seguida, é colocado o blob epóxi, que substitui o pacote de chips. Esta é uma técnica de fabricação de alto volume.
Sim, você pode usar epóxi na maioria das coisas eletrônicas sem problemas. O único problema é a dissipação de calor. Se a peça dissipa calor suficiente, é necessário considerar o isolamento térmico extra adicionado pelo epóxi. Pessoalmente, uso cola quente na maioria das coisas. Não vive tanto quanto epóxi, mas para protótipos que não importam.
Considere também se isso realmente importa. Qualquer cliente que entenda o desenvolvimento do produto entenderá que haverá várias rotações de uma placa e as rotações iniciais podem ter algum retrabalho manual. Use cola quente ou epóxi para amarrar as coisas para tornar a placa retrabalhada robusta mecanicamente o suficiente, mas tentar ocultar o retrabalho soa tolo e provavelmente não funcionaria de qualquer maneira. Uma gota de cola quente ou cola quente em uma placa, sem uma boa razão, parece muito mais estúpida do que um pequeno retrabalho.