Sim, você pode usar um divisor de tensão (de fato, existem poucas outras abordagens práticas).
Você precisará usar um resistor de precisão para o resistor de alto valor classificado para operar com segurança em 1000V. Não negligencie esse detalhe. Você também terá que seguir as recomendações de layout - o que pode envolver a fresagem de um slot de isolamento sob o resistor para aumentar a distância de fluência, a menos que o próprio resistor seja realmente longo e envolverá definitivamente outras considerações de PCB na entrada de alta tensão.
A resistência geral do divisor será limitada pela impedância de saída que você precisa alcançar, e isso será determinado pelo ADC se você tentar entrar diretamente na entrada do ADC. Provavelmente, isso não será desejável porque (para precisão total) o ADC precisa ver alguns k ohms em sua entrada. Diga que é 2,5K. Então você precisará usar 1M (ou menos) para o resistor de alto valor, e ele dissipará 1W (ou mais) a 1000VDC - não excelente para precisão (e carrega a entrada significativamente - 1mA a 1kV).
Pode ser melhor usar um buffer op-amp de alto desempenho na entrada ADC, permitindo que você use mais como 10M e 25K.
Se você tiver tensões de alimentação mais altas em seu sistema, pode haver uma pequena vantagem em dividir para uma tensão mais alta, como 10V com uma alimentação de 15V e, em seguida, armazenar em buffer e usar um segundo divisor passivo para descer para 2,5V, mas provavelmente não é necessário apenas com resolução de 12 bits. Reduziria o efeito do deslocamento do amplificador operacional e do desvio de deslocamento, ao custo de envolver mais dois resistores no orçamento de erros (mas o de alta tensão deve ser sua principal fonte de preocupação).