O Eagle realmente possui esses dois recursos a partir da versão 6. No site:
Beneficie-se do roteamento de pares diferenciais e dos meandros automáticos
Sinais especiais podem ser roteados exatamente com o mesmo comprimento. O roteamento de pares diferenciais é usado para pares de sinais diferenciais (iguais e opostos) em toda a placa para criar um sistema de transmissão balanceado. A criação de meandros ajuda os usuários a atribuir automaticamente um sinal a um determinado comprimento no PCB. Os meandros nos traços são usados para aumentar os tempos de atraso nos circuitos digitais de alta velocidade.
http://www.cadsoftusa.com/eagle-pcb-design-software/new-in-v6/?language=en (na metade do caminho)
Veja por si mesmo.
O botão Meandro:
Correspondência de comprimento de um par diferencial (do manual):
Na verdade, não sei como implementar essas técnicas, mas posso apontar a documentação. Consulte o manual (aviso de mais de 300 páginas em PDF) nas páginas 175 a 178 - http://www.cadsoft.de/wp-content/uploads/2011/05/V6_manual_en.pdf