Pessoalmente, uso a mesma coisa que desde criança; um pequeno "armário" cheio de gavetas de plástico. Você os vê em qualquer loja de ferragens para pregos, parafusos, porcas e parafusos. Barato e funciona muito bem, apesar de o gabinete dar dicas de que você precisa de um emprego.
Eu os organizo numericamente; Começando com os menores capacitores (1-50pf, 51-500pf, 501-999pf, etc.) em qualquer "salto" que funcione. Por exemplo, pareço usar apenas limites de 4.7pf, 22pf, 47pf e 100pf nesse intervalo, para que todos eles estejam em uma posição. Eu tenho as tampas 0402, 0805, 1206 e orifício na mesma gaveta, a menos que as peças TH sejam grandes. Realmente não é uma tarefa tão grande puxar uma gaveta e procurar o pacote certo.
Para valores "comuns" (0,01uF, 0,1uF, 10uF, etc.), cada um recebe uma gaveta só para si, geralmente com a variedade de orifícios na sua própria gaveta. Acho que compro 500 do mesmo tipo de boné e apenas o tamanho SMT ocupa a maior parte da gaveta.
Eu faço o mesmo com resistores e indutores.
Para dispositivos semicondutores, eu tenho todos os diodos de sinal pequeno em uma gaveta, todos os zeners em outra, todos os retificadores em outra (novamente, com TH na própria gaveta porque são grandes) ... Eu tenho uma gaveta cada para LEDs vermelho, verde, amarelo e azul, e meus transitores NPN e PNP também têm gavetas separadas.
Arame de solda e cabelo de anjo (na verdade, eu uso fio 30AWG "nu" (ônibus) e tubos de nylon 26 ou 28AWG) passam por hastes roscadas que ficam em um suporte feito de ferro angular. Isso permite que os carretéis girem e os mantém afastados.
Acho que vou acabar colocando todos os dispositivos de furo passante em um armário separado de gavetas. CIs que costumo guardar em uma caixa, embora os dispositivos menores e mais comuns também acabem nas gavetas.
Geralmente eu manter os componentes SMT NOS plásticos digikey ou Mouser mangas (. Aqueles com as etiquetas digikey sobre eles) me ajuda com dois problemas: a perda de peças pequenas e re-ordenação. Além disso, se uma gaveta derramar, é fácil de limpar e é impossível arquivar a peça na gaveta errada por engano. (Também tiro uma gaveta de cada vez quando estou construindo pranchas, o que ajuda a evitar confusões.)