De fato, a placa PSoC não possui um cristal de 32.768kHz. O símbolo está lá como uma descrição de como os pinos poderiam ser usados.
Em vez disso, os pinos XTAL (P15_2 e P15_3) são roteados para permitir que sejam usados como GPIO.
Os capacitores estão presentes na placa porque sua presença (22pF é pequena) dificilmente afeta qualquer circuito conectado externamente quando os pinos estão sendo usados como GPIO, minimizando o circuito externo necessário se estiver usando um cristal. Se você deseja um cristal de 32k, basta conectá-lo aos dois pinos GPIO e nada mais.
Isso pode ser visto nos diagramas e na descrição do guia do usuário (Página 30) :
Dois capacitores de polarização: necessários para a interface de um oscilador de cristal externo de 32 kHz. Esses capacitores são adicionados na versão Rev * A do kit de prototipagem PSoC 5LP.
Nota: O oscilador de cristal não está colocado na placa, pode ser soldado nos pinos P15_2 e P15_3 .
Observe o "Oscilador externo de cristal".
Para a sua placa, se você deseja ter um oscilador de cristal, conecte-o corretamente. Se você não quiser o oscilador de cristal, basta removê-lo junto com seus capacitores.