Normalmente, se você aguenta a queda de tensão, usa um diodo de cada fonte do circuito. Dessa forma, os suprimentos não retornam um ao outro.
Se você não aguenta a queda de tensão, use FETs para trocá-los para o circuito, usando um pouco de lógica para ativar o FET desejado, com base na combinação de suprimentos conectada.
Mas se você está apenas começando em eletrônica, e não tem certeza do design da fonte de alimentação, escolha os diodos.
Cada diodo terá uma queda de tensão, uma classificação de corrente e uma potência para dissipação. Como você está desenhando a partir de uma porta USB, sua corrente não ultrapassará 500mA e essa corrente com queda de tensão é inferior a um watt em dissipação de energia; portanto, desde que você escolha diodos de energia, tudo ficará bem.
A queda de tensão para um diodo 1N4001 padrão (US $ 0,30 cada na Digikey ) é de cerca de 1 V a 1 A, portanto a saída para o seu circuito seria de 4V. Se você quisesse obter uma queda de tensão mais baixa, passaria para o diodo Schottky, como um 1N5817 que tem uma queda mais próxima de 450mV a 1 A, de modo que a tensão no lado de saída seria de 4,55V. Esse diodo é apenas mais alguns centavos.
Se, no entanto, você precisar exatamente de 5 volts no circuito, precisará procurar outros métodos de comutação, como os FETs. No entanto, lembre-se de que será mais caro e quase todas as outras opções simples ainda incluem uma queda de tensão.
A maioria dos dispositivos e circuitos de 5V funcionará bem em 4,5V, basta verificar cuidadosamente suas especificações e fazer alguns testes.