Encontrei uma folha de dados MSDS para o material FR-4 , que é comumente usada em PCBs.
Luzes:
A usinagem, retificação ou serragem deste material podem gerar pós nocivos. A fibra de vidro de filamento contínuo não é considerada flbrogênica; no entanto, é tecido a partir de fibras de vidro E, que são listadas pela IARC como "fibras de vidro para fins especiais" e designadas como "possibilidade de cancerígeno em humanos". A inalação de vapores de cobre, embora não se espere que ocorra sob condições típicas de uso, pode causar febre de vapores metálicos.Veja a Seção 8 para controles de exposição.
A seção 8 citada diz:
CONTROLES DE ENGENHARIA: Use exaustão local ao usinar, retificar ou lixar para minimizar as exposições e manter as concentrações de poeira e fibras transportadas pelo ar abaixo dos limites de exposição ocupacional.
EQUIPAMENTO DE PROTEÇÃO PESSOAL: PROTEÇÃO RESPIRATÓRIA: Na ausência de ventilação geral ou local adequada, use um respirador aprovado pelo NIOSH ou pela autoridade local com pelo menos um filtro N95 se os limites de exposição forem excedidos.
PROTEÇÃO DA PELE: Use luvas durante contato prolongado para evitar irritações na pele.
PROTEÇÃO OCULAR: Use óculos de segurança ou proteção facial ao usinar, retificar ou serrar este material.
Então, usando uma máscara e um ventilador, você provavelmente se manteve razoavelmente seguro. Você pode considerar adquirir um aspirador de pó eletrônico que atenda ao N95 para coletar e conter poeira que, de outra forma, poderia escapar no ar.