No console do Python, execute o seguinte:
import sys
sys.path
Veja se sua entrada PYTHONPATH está listada. Acho que não, pois essa variável de ambiente provavelmente não está disponível para o Python em execução do QGIS.
Para adicionar sua pasta de scripts ao sys.path do console, faça um append regular ():
sys.path.append('~/Scripts/python')
Então você deve poder importar seus módulos de lá para essa sessão do console. Eu recomendo expandir o ~ para o caminho inicial completo do usuário (não tenho certeza se o Python faz ~ expansão).
EDIT : ~ expansão não parece ser suportada pelo sys.path (no Mac, pelo menos).
O console Python do QGIS é criado por um módulo Python, 'console.py'. Portanto, se você deseja adicionar seu caminho personalizado ao sys.path de uma maneira mais permanente, edite o arquivo console.py e adicione a instrução sys.path.append ('path / to / my / scripts') após o módulo seção de importações.
O console.py está localizado aqui (para Mac, usando o pacote QGIS KyngChaos.com ):
/Applications/QGIS.app/Contents/Resources/python/qgis/console.py
Obviamente, este é um hack que será apagado e precisará ser refeito em uma atualização do QGIS.app.
Qualquer ajuste no sys.path do interpretador QGIS Python em execução também está disponível para outros plugins.
Uma alternativa mais segura pode ser criar um plug-in PyQGIS de desenvolvimento simples que carrega e apenas executa o sys.path.append (), sempre que você desejar. Ele também pode remover esse caminho do sys.path no plugin unload (). Não testei se o ajuste sys.path de um plug-in estaria disponível em um console já carregado (suponho que sim).
~/Scripts/python
ao PATH que normalmente funciona para mim. Verifique comimport os; os.path