Outra opção, sem precisar da função
update points set country = t1.country from
(
select points.oid, countries.name as country from
countries INNER JOIN points on st_contains(countries.wkb_geometry,points.wkb_geometry)
) t1
where t1.oid = points.oid
Eu suspeito (embora não tenha testado) que isso será mais rápido do que usar uma função aninhada como no seu exemplo.
Minha saída da execução explica (espero que pareça semelhante). Se você obteve mais resultados de verificação Seq, é algo para se olhar, talvez os índices não estejam configurados corretamente.
Update on points (cost=1.18..29.40 rows=121 width=129)"
-> Nested Loop (cost=1.18..29.40 rows=121 width=129)"
Join Filter: _st_contains(countries.geometry, public.points.geometry)"
-> Hash Join (cost=1.18..2.37 rows=28 width=220)"
Hash Cond: (public.points.oid = public.points.oid)"
-> Seq Scan on points (cost=0.00..1.08 rows=28 width=114)"
-> Hash (cost=1.08..1.08 rows=28 width=110)"
-> Seq Scan on points (cost=0.00..1.08 rows=28 width=110)"
-> Index Scan using "countries_Idx" on countries (cost=0.00..0.91 rows=1 width=414)"
Index Cond: (geometry && public.points.geometry)"