Percebo que essa é uma pergunta relativamente antiga, mas, como consultora de consultoria, adquiri muita experiência com levantamentos de árvores e criando representações gráficas de linhas de gotejamento e zonas de proteção de raiz, usando o QGIS especificamente.
Dito isto, eu tenho que adotar a abordagem da CHenderson, pois ela é usada em todos os inventários que conduzo. Qualificarei esse endosso dizendo que também tentei a abordagem descrita por Underdark e descobrirei que o tamanho dos círculos muda à medida que a escala do mapa muda.
A criação de arquivos shapefiles adicionais também tem a vantagem de a representação gráfica ser mantida, caso você queira exportar o shapefile para o CAD (eu faço isso praticamente 100% do tempo). Como as medições de árvores são usadas para a edificação de engenheiros e afins, um produto CAD é mais valioso e fácil de trabalhar com eles.
Eu também o desencorajaria de adicionar à tabela de atributos sempre que possível. Dependendo do tamanho do seu inventário, isso pode ser muito entediante e aumenta a probabilidade de erro. Em vez disso, colete dados relevantes no campo, transcreva-os para um formato digital (se você não estiver coletando digitalmente via PDA, tablet, GPS etc.) e importe-os para o QGIS como um arquivo .csv. A maioria dos outros dados pode ser adicionada usando a calculadora de campo, incluindo os raios da zona de proteção (que em Ontário são baseados no diâmetro do tronco ou na linha de gotejamento).