Estou usando o ArcGIS Desktop 10.0.
Eu tenho um truque para remover os furos de rosca, que é converter o polígono em linha e, em seguida, criar polígono a partir das linhas e, no final, mesclar todos eles. A desvantagem dessa estratégia é que remove outros buracos e áreas vazias que, na realidade, estão vazias e devem ser mantidas vazias. Veja abaixo a imagem: