Citando Frank Warmerdam , o mantenedor:
Eu o declaro "goodle". Originalmente, pensei em chamá-lo de "Biblioteca de Abstração de Dados Orientados a Objetos Geoespaciais" (GOODAL) para tornar o som certo óbvio, mas eu estava com preguiça de digitar GOODAL o tempo todo, então deixei de lado a parte OO. Algumas pessoas podem dizer que eu tirei isso de mais do que o nome. :-)
A maioria das pessoas pronuncia a biblioteca "gee-dal", o que também é legal, mas não é a minha preferência.
FWIW, acho que a pronúncia "goodle" é ouvida com mais frequência do que não, e uso a que aparece espontaneamente da grafia.
Edit: Como Ragi apontou nos comentários, o próprio Frank mudou de pronúncia original durante o tempo em que trabalhava no Google. Pessoalmente, ouvi pessoas próximas ao projeto usarem a pronúncia "goodle".