O que você está usando para criar os gráficos?
A maioria dos pacotes de software permite definir suas cores após a criação do gráfico. Nesse ponto, é uma questão de decidir sobre uma paleta. Em um gráfico de pizza, eu prefiro ter cores bastante diferentes para cada "fatia", especialmente se houver várias "fatias" pequenas. Por exemplo, é realmente difícil dizer a diferença entre alguns tons de roxo e alguns tons de azul, se forem realmente pequenos. Ou, na sua falta, verifique se as cores "semelhantes" estão separadas umas das outras (como os azuis neste gráfico).
Para gráficos de barras, você pode se dar bem com uma paleta bastante próxima - variações nos mesmos tons de azul, por exemplo, provavelmente serão boas, pois há uma clara separação visual entre as colunas:
Você poderia, é claro, tornar uma barra de uma cor completamente diferente se você estiver tentando chamar a atenção do público para um único ponto de conversa ("... e como você pode ver, seria muito mais barato criar um exército de zumbis do que ter que pagar a legiões de soldados vivos salários e benefícios ... ".
Uma outra palavra de cautela: tenha cuidado ao usar padrões em qualquer um desses; os gráficos geralmente dependem do olho humano para poder distinguir a diferença entre as bordas das as várias formas e um padrão podem facilmente interferir nessa capacidade.Se você for usar um padrão em um gráfico, verifique se ele não distrai.
BTW, usei o MS Excel para fazer isso como um conjunto de ilustrações rápido e sujo. Você pode clicar duas vezes nas partes do gráfico para reatribuir cores, etc. Claramente, o processo será diferente dependendo do que você está usando para criar os gráficos.