Como você está perguntando "por que eles são percebidos de maneira diferente", aqui está outra coisa (muito nerd) a considerar: a luminescência percebida de uma cor RGB. Isso é difícil de aplicar, portanto, responda minha resposta quase da mesma maneira que trivialidades :)
O valor de luminescência de uma cor indica como você o "acende". Se a cor fosse uma lâmpada, uma cor com baixa luminescência seria percebida como fraca (lâmpada de 40W), enquanto uma cor com alta luminescência seria percebida como muito brilhante (lâmpada de 100W).
De fato, as cores RGB são exibidas usando pequenas "lâmpadas". As telas são compostas de pequenas "lâmpadas", três para cada pixel: R (ed), G (reen) e B (lue). Os valores específicos de R, G ad B de uma cor indicam o quão brilhante cada pequena lâmpada deve acender para criar a ilusão dessa cor. Por exemplo, a cor laranja RGB (255, 100, 0) é criada girando a lâmpada vermelha até sua potência máxima (255), tornando a lâmpada verde semi-escura (100) e desligando a lâmpada azul (0).
Aqui está uma ilustração mostrando algumas cores e como "brilhante" cada um dos componentes RGB deve ser criado para criar a ilusão da cor. Os pontinhos abaixo de cada cor indicam quão escuro ou brilhante o componente é produzido.
Como você pode ver na ilustração, para criar branco, por exemplo, você gira os três componentes ao máximo (255). Essa combinação das três pequenas "lâmpadas" é percebida pelo olho como branca (explicando por que seria uma grande digressão). Para criar preto, você desativa todos eles. Isso é fácil: sem luz, sem cor.
A luminescência de cada cor é calculada adicionando "quão brilhante" cada um dos 3 componentes é. O branco seria a cor com maior luminescência, já que os três componentes são voltados para o seu valor máximo. Preto, seria o mais baixo. O amarelo teria uma luminescência mais alta que o verde, pois para tornar o amarelo você precisa de 2 componentes no máximo, mas para tornar o verde, você só precisa de um. Então, mais ou menos você poderia dizer que
L = R + G + B
É um pouco mais complicado. Observando a ilustração, você perceberá que o componente verde parece mais brilhante. Na verdade, é percebida pelo olho como a mais brilhante. O azul, por outro lado, é percebido como muito escuro. A fórmula exata para calcular a luminescência leva isso em consideração.
L = 0,2126 R + 0,7152 G + 0,0722 B
Aqui está a ilustração novamente, com a luminescência calculada para cada cor.
Você notará que, como seus olhos poderiam ter lhe dito, o amarelo é mais luminoso que o laranja, mas o laranja é mais ou menos tão luminoso quanto o magenta.
Agora, peguei as cores de duas de suas paletas originais e calculei sua luminescência.
No primeiro caso, o que você gosta, notará que a luminescência da primeira cor, na parte inferior, é mais baixa (125) do que a da segunda cor, na parte superior (200). O gradiente, então, é percebido como um aumento na luminosidade, como se estivesse acendendo.
No segundo caso, não há muita diferença; portanto, o gradiente é percebido apenas como uma mudança de matiz.
No terceiro caso, a cor inferior tem uma luminescência mais alta que a superior, de modo que o gradiente é percebido como uma diminuição da luminosidade, como se estivesse escurecendo.
Isso explicaria por que, mesmo quando você seleciona duas tonalidades que são colocadas relativamente à mesma distância uma da outra na roda de cores que as que você gosta, o resultado seria percebido de maneira diferente.