Respostas:
Exemplo diff:
< xlink:href="file:///home/foouser/svg/20150721_210652-0.JPG"
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> xlink:href="20150721_210652-0.JPG"
Após salvar, fechar e mover o arquivo svg junto com o arquivo de imagem, o Inkscape ainda deve exibir a imagem no seu arquivo. Observe também que, após a reabertura, o Inkscape manterá o atributo xlink: href, mas também manterá um atributo separado chamado sodipodi: absref que armazenará a localização absoluta da imagem. Descobri que isso não importa - você ainda pode mover seus arquivos e o Inkscape consultará o atributo xlink: href para encontrar sua imagem.
Testado no Inkscape 0.48
../stuff/file.ext realmente deve funcionar.
Para um guia completo, consulte aqui: http://libregraphicsworld.org/blog/entry/inkscape-embedding-or-linking ;-)