Se você possui o Adobe Illustrator, aqui está o que você precisa fazer.
Você precisa salvar seu arquivo no formato Illustrator.
Faça o download do script para exportar os arquivos png, mantendo certa camada visível (ele faz exatamente o que você deseja, mas no Illustrator):
script
Em seguida, você precisa adicionar + ao nome da camada de plano de fundo (ele fará com que o plano de fundo apareça em todas as imagens exportadas - você pode ler mais sobre isso no link.)
Altere todos os nomes de camadas para algo diferente do nome padrão.
vamos para
File->Scripts->Export-Layers-as-PNG
Escolha um local e pronto (para mim, só funciona se eu escolher o local para minha área de trabalho).
Se você não possui o Illustrator, precisa encontrar / aprender a criar / solicitar que eu faça / um script que faça a mesma coisa que o script do ilustrador, exceto no Photoshop.
Você pode tentar executar o script com o Photoshop colocando-o na pasta de scripts do Photoshop e depois indo
File->Scripts->Export-Layers-as-PNG
mas não funcionou para mim.
boa sorte :)