OK, então suponho que você tenha duas imagens: uma imagem normal à qual você deseja adicionar transparência e uma imagem em escala de cinza que deseja usar como canal alfa (transparência), algo como:
(Imagem base com base nesta foto de John Fielding , usada sob a licença CC-By-SA 2.0 ; máscara alfa criada por mim usando a ferramenta Sphere Designer do GIMP.)
Existem várias maneiras de fazer isso; deixe-me descrever alguns deles.
Método 1: Abra as duas imagens no GIMP. Selecione a imagem em escala de cinza e copie-a para a área de transferência ( Editar → Copiar ou Ctrl+ C). Na imagem base, selecione Camada → Máscara → Adicionar máscara de camada ... (também disponível clicando com o botão direito do mouse na camada na caixa de diálogo Camadas). Não importa o que você escolher como máscara, pois a substituiremos em breve.
A máscara de camada que você acabou de adicionar deve ser selecionada para edição; caso contrário, selecione-o com Camada → Máscara → Editar máscara de camada (ou apenas clique na máscara na caixa de diálogo Camadas). Cole a imagem em escala de cinza em ( Editar → Colar ou Ctrl+ V) e ancore a seleção flutuante resultante na máscara ( Camadas → Camada âncora ou Ctrl+ H, ou clique no ícone Âncora na caixa de diálogo Camadas).
Opcionalmente, transforme a máscara de camada em um canal alfa real usando Camada → Máscara → Aplicar máscara de camada (mas simplesmente exportar a imagem como PNG fará isso por você).
Método 2: Abra as imagens como camadas ( Arquivo → Abrir como camadas ... ) ou cole uma como uma nova camada na outra. Com a camada de imagem em escala de cinza visível, abra a caixa de diálogo Canais, clique com o botão direito do mouse em um dos canais Vermelho / Verde / Azul (todos devem ser idênticos) e selecione Canal para seleção . Inverta a seleção com Selecione → Inverter ou Ctrl+ I.
Selecione a camada de imagem base na caixa de diálogo Camadas. Adicione um canal alfa a ele com Camadas → Transparência → Adicionar canal alfa, se ele ainda não tiver um, e retire a seleção da camada ( Selecione → Recortar ou Ctrl+ X).
Método 3: Como o método 2, mas depois de Canal para seleção , não inverta a seleção, basta usar Camada → Máscara → Adicionar máscara de camada ... na camada de imagem base e escolha "Seleção" na caixa de diálogo. Em seguida, aplique opcionalmente a máscara como no método 1.
Em qualquer caso, qualquer que seja o método que você usou, o resultado deve ficar assim (PNG transparente real à esquerda, com fundo quadriculado à direita):