Infelizmente, você não poderá trabalhar no Magento sem conhecer pelo menos um pouco de PHP, então eu recomendo que você aprenda pelo menos o básico da linguagem (incluindo como usar as classes ).
Se você pretende se concentrar apenas no estilo da página (nenhuma funcionalidade nova que exija algumas alterações no código), você deve observar como os layouts e os temas do magento funcionam. Todo o conteúdo pode ser encontrado na app/design
pasta e este é o lugar onde menos PHP pode ser encontrado.
Os arquivos de layout definem (se não especificado de outra forma no código) quais blocos, arquivos css e javascript serão adicionados aonde (este é o local para onde sua inclusão de javascript deve ir).
Os modelos são os arquivos de conteúdo HTML do bloco real (é lá que a maior parte do HTML é escrita e alterada dinamicamente com o PHP).
Observe que os arquivos de layout e modelo podem ser substituídos colocando-os em locais diferentes, para que você nunca reescreva os arquivos de layout e modelo padrão.
Recursos
O melhor recurso seria examinar os arquivos de modelo e layout padrão já existentes.
Google :)
Estouro de Pilha - Este link é sobre como adicionar seu próprio arquivo JS ao tema
Tutoriais de Alan Storm - Eles são mais técnicos, então você deve aprender PHP básico primeiro (ele também escreveu um livro que cobre extensivamente o sistema de layout Magento, mas requer que você saiba PHP).
Magento para designers - eu não li os tutoriais, mas eles parecem passar pelo Magento sem esperar muito conhecimento de PHP