Isso deve funcionar para você:
$collection = $this->collectionFactory->create();
$collection->addAttributeToFilter('status', ['in' => $this->productStatus->getVisibleStatusIds()]);
$collection->setVisibility($this->productVisibility->getVisibleInSiteIds());
As classes usadas são:
/**
* @var \Magento\Catalog\Model\Resource\Product\CollectionFactory
*/
protected $collectionFactory;
/**
* @var \Magento\Catalog\Model\Product\Attribute\Source\Status
*/
protected $productStatus;
/**
* @var \Magento\Catalog\Model\Product\Visibility
*/
protected $productVisibility;
Revise essas classes para verificar outros métodos para obter possíveis valores de status ou visibilidade.
No entanto, revise o conceito de repositórios, tanto quanto vi que o Magento 2 recomenda usar o repositório para acessar os dados do produto em vez de usar a coleção. Por exemplo:
$searchCriteria = $this->searchCriteriaBuilder->create();
$products = $this->productRepository->getList($searchCriteria)->getItems();