O SCTP geralmente funciona e nenhum suporte especial é necessário, pois você sugeriu que é apenas carga útil para pacotes IP.
Certamente alguém está bloqueando protocolos IP específicos (considerando quantos caras do FW acham que o ICMP deve ser bloqueado), mas isso seria uma exceção e não uma regra, em geral todos os protocolos IP funcionam muito bem.
O teste rápido no anel nlnog com hping3 -c 1 -n 194.100.40.53 -0 --ipproto 132
cerca de 210 caixas resultou em 59 pacotes entregues, portanto apenas 59/210 trabalharam em testes da vida real.
Eu nunca ouvi falar de um provedor de transporte real que filtre protocolos IP, por isso é o FW corporativo que protege a LAN que geralmente é o culpado. Contanto que você controle as extremidades da conexão com a Internet, você estará bem.