Então, o que aconteceu é chamado de Agressão por Não Reconhecimento .
Então imagine como deve ser ameaçador para o gato que ficou em casa ver um gato sair da transportadora, para seu território, que carrega aromas desconhecidos. De fato, quando se trata de não cheirar como ela mesma, a situação se agrava porque os aromas são muito ameaçadores (do ponto de vista de gatinhos)
O gato que volta não tem o mesmo cheiro e na verdade carrega aromas que o gato que volta associa ao medo. Não são muitos os gatos ansiosos por uma visita ao veterinário. Ter seu gato companheiro realmente trazendo aqueles aromas ameaçadores para o seu território? Hora de entrar em pânico!
O artigo vinculado (de Pam Johnson Bennett, uma especialista em comportamento de gatos que eu recomendo), inclui algumas dicas de como evitar essa situação, mas, como você já tem três meses, não sei se eles funcionarão.
Eu suspeito que você precisará dar a eles um período de reflexão para tentar esquecer a agressão. Tranque um deles em um quarto (com comida, água, lixo) por tempo suficiente para que você pense que eles esquecerão que estão chateados um com o outro. Uma gaiola não funcionará porque eles poderão se ver.
Então comece a apresentá-los como se nunca tivessem se conhecido antes. Pegue um cobertor que CatA tenha colocado e coloque-o no quarto de CatB e vice-versa. Coloque o CatB em outra sala e deixe o CatA explorar a sala do CatB, etc. Quando eles começarem a interagir juntos, verifique se você tem um brinquedo de brincar à mão, para que, se parecerem zangados, você possa redirecionar essa energia para o jogo.
Provavelmente levará alguns meses para que eles coabitem juntos como estavam antes, mas seja paciente e você pode fazê-lo.